Babiš vystudoval Vysokou školu ekonomickou. V 80. letech byl vyslán jako delegát do Maroka, kde zastupoval asi 15 podniků zahraničního obchodu (PZO), například Motokov.
Po návratu do země působil ve společnosti Petrimex jako ředitel obchodní skupiny dovážející veškeré suroviny pro výrobu hnojiv. V obchodu s hnojivy později začal podnikat.
Vznik Agrofertu
V roce 1993 založil společnost Agrofert. O rok později získal od americké Citibank úvěr ve výši čtyř milionů dolarů a začal nakupovat sklady, zemědělské podniky, výrobu hnojiv a chemie.
Během let vyrostla skupina Agrofert v gigant, který podniká v Česku a na Slovensku prostřednictvím více než dvou set firem a zaměstnává přes 20 tisíc lidí. Je vládcem českého zemědělství a potravinářství, podniká také v chemickém průmyslu, obnovitelných zdrojích nebo lesnictví.
Babiš je slovenský rodák s českým občanstvím. Časopis Forbes v roce 2020 vyčíslil jeho majetek 74 miliard korun.
V červnu 2013 jeho společnost Agrofert koupila mediální skupinu MAFRA, pod kterou spadá také deník MF DNES i portál iDNES.cz.
Začátkem roku 2017 vložil svůj majetek do nově založeného svěřeneckého fondu.
V září 2023 se investiční skupina Kaprain a Agrofert se dohodly na prodeji chemických závodů Synthesia, společnosti MAFRA a společnosti LONDA. Stoprocentní majetkový podíl v těchto společnostech získá Kaprain po schválení příslušnými antimonopolními úřady.
Babiš je podruhé ženatý. V červenci 2017 si vzal dlouholetou partnerku Moniku. Žije v Průhonicích u Prahy, kde vlastní dvě rozlehlé vily. Místní sokolovnu přestavěl na sportovně rekreační zařízení.
Vstup do politiky
Na podzim 2011 založil hnutí ANO 2011, které původně vzniklo jako iniciativa kritizující korupci a poměry v Česku. V květnu 2012 získalo registraci ministerstva vnitra jako politická strana. Na podzim 2012 vyslalo sedm kandidátů do senátních voleb, ale žádný z nich neuspěl.
V roce 2013 bylo hnutí ANO druhou nejsilnější stranou parlamentních voleb. Babišova strana získala 18,65 procent hlasů a do parlamentu vyslala 47 nových poslanců.
Hnutí ANO uzavřelo koaliční smlouvu s ČSSD a KDU-ČSL a vstoupilo do vlády Bohuslava Sobotky. Hnutí připadlo celkem šest resortů. Andrej Babiš se stal prvním místopředsedou vlády a ministrem financí. Z funkcí byl odvolán v květnu 2017. Na ministerstvu financí ho nahradil Ivan Pilný.
V parlamentních volbách 2017 hnutí ANO jasně vyhrálo a Andrej Babiš obhájil svůj mandát. Začátkem prosince 2017 ho prezident Miloš Zeman jmenoval premiérem, byl tak dvanáctým předsedou vlády v historii ČR. O několik dnů později prezident jmenoval i jeho menšinový kabinet. Ten ale v lednu 2018 nezískal důvěru poslanců a schválil svou demisi.
Ve středu 6. června 2018 prezident Zeman jmenoval Andreje Babiše premiérem podruhé. Jeho druhá, menšinová vláda ANO a ČSSD, pak získala důvěru Poslanecké sněmovny v červenci 2018. Stalo se tak dvě stě šedesát čtyři dní po volbách a po dlouhém jednání poslanců, které trvalo šestnáct hodin.
Andrej Babiš obhájil svůj poslanecký mandát i ve volbách 2021, ale hnutí ANO volby nevyhrálo a skončilo v opozici.