Syn známého dramatika a chartisty Josefa Topola a vnuk velkého českého spisovatele Karla Schulze poprvé vystoupil v roce 1978 jako třináctiletý sólově na Hrádečku u Václava Havla v úvodu legendárního koncertu Plastic People of the Universe Pašijové hry velikonoční.
Hrál písně na texty svého o tři roky staršího bratra Jáchyma, dnes významného spisovatele a básníka.
Ve svých třinácti také spolu se svými spolužáky ze základní školy, baskytaristou Janem Hazukou a bubeníkem Davidem Skálou, založil kapelu Psí vojáci a právě Filip byl ústřední postavou tohoto uskupení. Název kapely přitom inspirovali indiánští válečníci z románu Malý velký muž.
Poprvé Psí vojáci vystoupili veřejně na Pražských jazzových dnech v roce 1979. Od té doby pak kapela působila převážně v ilegalitě, hrála na soukromých undergroundových akcích, její domovskou scénou se stal pražský Junior klub Na Chmelnici a vystupovala též pod krycím názvem P.V.O. (Psí vojáci osobně).
Do roku 1990 se Topol živil jako programátor, kromě toho hrál i v několika filmech, například ve snímku Žiletky režiséra Zdeňka Tyce. Poslední koncert odehráli Psí vojáci s Filipem Topolem 25. května 2013 v Amsterdamu.